1.扫描仪是一种非常精细的设备，里面有很多光学器件，扫描仪工作时，光从灯管发出后到CCD接收其间要经过玻璃板以及若干个反光镜片及镜头，其中任何一部分落上灰尘或其它微小杂质都会改变反射光线的强弱，从而影响扫描图像的效果。如果脏了肯定会影响扫描的效果。所以定期清理肯定是少不了的工作。
2.不要轻易的打开扫描仪的外壳，避免震动、倾斜等操作。
在工作的过程中，不要随便地改动这些光学装置的位置，同时要尽量避免对扫描仪的震动或者倾斜。遇到扫描仪出现故障时，在不确定故障原因时最好不要擅自拆卸扫描仪。在拆卸和送修时请将扫描仪锁拨到锁定位置以保护扫描仪的光学原件。
3.不要中途切断电源。由于镜组在工作时运动速度比较慢，当扫描一幅图像后，它需要一部分时间从底部归位，所以大家在正常供电的情况下不要中途切断电源，等到扫描仪的镜组完全归位后，再切断电源。现在有一些扫描仪为了防止运输中的震动，还对镜组部分添加了锁扣，可见镜组的归位对镜组的保护有多么的重要。扫描仪在使用中也不要在扫描的过程中移动物品。
4.不要经常插拔电源线与扫描仪的接头。这样经常插拔电源线与扫描仪的接头，会造成连接处的接触不良，导致电路不通。不要随意热插拔数据传输线，这样比较容易损坏扫描仪或计算机的接口。
5.不要在扫描仪上放置物品。因为扫描仪比较占地方，在不适用的时候很多人就习惯把一些书、文件之类的物品放在上面。其实后这样很容易导致扫描仪的塑料遮板变形，影响使用。如果是长久不用时，请切掉电源，放置在远离灰尘的地方。
6.不要随便拆装这些光学装置以免出现位置上的偏差，同时在装运扫描仪时最好能把扫描仪做一定的固定，以避免对扫描仪的震动或者倾斜。如果扫描仪出现故障，不要自己尝试去修理它，要送到专门的维修站去修理。